식물 집단의 유전적 다양성과 집단 간 유전적 분화는 교배양식과 더불어 물리 및 생리적 장벽에 의한 유전자 이동(gene flow)의 정도와 개체군 및 개체 수 감소에 의한 유전적 부동(genetic drift) 등의 영향을 받는 것으로 알려져 있다 (Jacquemyn et al., 2004; Wang et al., 2008). 한반도에 분포하는 설앵초 집단은 제주도 한라산 지역과 한반도 남부 일부지역의 1,000m 이상의 아고산 지역에 주로 분포하고 있는데, 이처럼 아고산지역 산정부나 능선부를 피난처로 제한적으로 분포함으로써 집단 간에 지리적으로 격리되어 있고, 집단 내에서도 주변 식생의 천이와 피압으로 집단은 심각하게 분획화가 되거나 소멸되어 왔으며, 현재에도 계속 진행 중으로 멸절 위기에 처한 상태이다. 따라서 이러한 설앵초의 지사학적 및 진화사로 미루어 볼 때 비록 이형화주의 교배기작을 가지고 있음에도 불구하고 설앵초 집단에서 관찰되는 낮은 수준의 유전다양성은 현재 이들 식물 집단이 처해 있는 집단의 분획화와 집단 내 제한된 유효 개체수 크기에 기인한 유전적 부동 현상이 원인인 것으로 생각된다. 또한 설앵초 자연집단의 분포 양상으로 인해 인접 집단 간 화분의 제한적 이동과 원활한 종자산포가 어렵기 때문에 유전자 흐름이 제한적인 것으로 추정할 수 있으며, 이러한 요인들이 설앵초의 지역 간 및 집단 간 높은 유전적 분화를 야기한 것으로 생각된다. 특히 Yamazaki (2003)은 한반도에 분포하는 설앵초를 엽저의 형태를 근거로 육지형(Primula farinosa subsp. modesta var. koreana Yamazaki)과 제주도형(Primula farinosa subsp. modesta var. hannasanensis (Yamazaki) Yamazaki)으로 구분하여 별개의 변종으로 처리한 바 있는데 본 연구 결과에서도 K=2에서 두 지역 간 명확한 유전적 구조양상을 보여줌으로써 분류학적 처리의 근거 자료를 제공하였다. 이처럼 설앵초와 같이 아고산지대에 잔존적으로 격리 분포하는 북방계 식물들은 현재 심각한 멸종 및 멸절 위협에 직면하고 있다. 이런 지사학적 분포 양상을 갖는 대부분의 식물 종은 개체수가 적어 근친교배와 유전적 부동에 의한 유전적 다양성의 감소 등에 의해 개체군 생존능력(population viability)의 저하로 지속적인 개체 수 감소 및 멸절이 우려되며 또한 무분별한 자생지 개발과 남획 등이 더해질 때 더욱 가속화 될 것으로 예측된다.