국립수목원은 2010년까지 지난 5년간 국내외 전문가 100여명이 참여하여 동북아시아 지역에서 식물, 곤충, 미생물의 다양한 생물표본을 확보하였다.

생물표본은 생물자원에 대한 시간적·공간적으로 중요한 증거가 되므로 전세계적으로 이슈가 되고 있는 기후변화에 의한 생물상 변화를 한눈에 알아볼 수 있는 기본 연구자료로, 생물다양성협약(COP10)과 유전자원의 접근 및 이익공유(ABS)을 위한 "나고야 의정서" 채택으로 각국은 생물주권 확보를 위한 노력이 강화됨에 따라 국립수목원은 우리 생물종의 주권 확보를 위한 국가적 차원의 생물표본 확보 사업을 추진하여 한반도 자생식물의 80%, 나비와 나방류의 60% 확보하였다.

이 사업을 통해 확보된 주요 생물종은 세계 최초로 앞털뭉뚝나물좀 등 신종과 신종 후보종 13종류와 한반도에서 그 분포가 확인되지 않았던 백운산방풀 등 미기록종 170종류 등이다. 또한, 외대으아리 등 특산식물 154분류군과 산림청 지정 희귀식물인 파초일엽 등 399분류군의 표본을 확보하였다.
※ 한반도 특산식물: 328종 (한반도 특산관속식물, 2005), 희귀식물: 571종 (한국 희귀식물 목록집, 2008)

수목원에서는 1990년대 초반까지 자생했으나 무분별한 채취로 인해 자취를 감추고 있는 석곡의 복원에 나설 수 밖에 없는 실정이었다. 석곡의 복원은 2008년부터 전남지역에서 자생하는 석곡 열매를 배양액에 파종하여 대량 증식한 후 개체를 분리하여 온실에서 적응 순화 시험을 거친 후 이루어졌다. 석곡 종자는 이러한 보존 작업과 연구 끝에 300개체까지 증식했다. 증식한 석곡은 향기나 모양 등이 자생 석곡과 똑같아 복원작업 2년여 만에 결실을 본 것이다. 결국 국립수목원과 전남 완도수목원이 공동으로 하여
우리나라 희귀식물 중 멸종위기종(CR)이며 동아시아 특산 식물인 석곡을 종자파종으로 대량 증식하는데 성공하였다.

또한 우리생물종의 원적부라 할 수 있는 기재문과 기준표본의 확보를 위하여, 미국 하버드대학 표본관 도서관, 독일 베를린 식물원 도서관 등에 소장되어 있는 한반도 식물 연구에 대한 문헌자료 25,000건을 확보하였으며, 일제 강점기에 연구되어 동경대학 표본관에 소장되어 있는 기준표본의 이미지를 포함한 870점의 기준표본을 확보하였다.

그 밖에 사업결과를 활용하여「한반도 관속식물 원기재문 I」,「한국식물도해도감2 양치식물」같은 전문 서적부터 「식별이 쉬운 나무도감」등 일반인의 산림생물 이해를 높이기 위한 서적까지 다양한 계층별 발간물로 정리되어 배포하였다. 또한 표본과 기재문, 기준표본 등은 국가표준식물목록(http://nature.go.kr/kpni)과 국가생물종 지식정보 사이트(http://nature.go.kr)를 통해 확인할 수 있다.

국립수목원은 2011년부터 향후 5년간 약 45억원을 투자하여 2단계 사업인 '한반도 산림생물표본 인프라 고도화 사업'을 확대 추진 중으로 한반도 생물종의 주권을 수호할 수 있는 동북아시아 허브 표본관으로 도약할 것이다.